三代全长转录组-产品介绍-威尼·至尊国际(中国)

全长转录组（三代）

全长转录组-三代测序助力转录组数据解读

全长转录组是基于PacBio平台或Nanopore平台进行测序取得物种转录组信息的方法，其可以取得mRNA全长序列，克服转录本拼接短、信息不完整的难题，实现可变剪切及融合基因等结构变异的研究。

应用方向

农学
完善基因组/转录组信息：复杂基因结构，转录本结构和功能分析。
差异/动态转录组：胁迫处理或不同时序转录组变化，动植物驯化机制。
比较转录组：近缘物种间亲缘关系，mRNA序列差异。
医学
融合现象解析：融合基因的癌症致病机理。
复杂基因转录本研究：疾病或癌症相关基因的复杂剪切形式。
定量转录组：基因/转录本水平定量，挖掘条件特异性基因/转录本。

诺禾优势

信息分析

威尼·至尊国际(中国)全长转录组测序项目信息分析，经过严格数据质控保证数据分析可靠性，准确获取转录本信息。

动植物多组学

疾病多组学

癌症多组学

微生物多组学

转录调控和蛋白多组学

表观遗传

送样建议

常见问题

1.全长转录组是否需要打断，拼接？
- 全长转录组是基于PacBio或Nanopore三代测序平台，无需打断拼接，直接取得包含5’，3’UTR，poly A tail的完整转录本，从而准确分析有参考基因组物种可变剪切及融合基因等结构信息，克服无参考基因组物种转录本拼接较短、信息不完整的难题。
2.全长转录组检测准确率如何？
- 三代测序碱基错误率是没有偏好性的，对于PacBio平台，研究全长转录组采用的是CCS（circular consensus sequencing read，环形一致性序列）测序模式，产生的HiFi read 通常平均质量值可达Q30以上；对于Nanopore平台，利用有参考基因组物种的基因组信息进行序列校正，也可以有效提高碱基校正效果。
3.全长转录组是否取得全部LncRNA
- 建库过程是顺利获得识别RNA上的Poly-A结构，将总RNA中的具有Poly-A的mRNA与部分具有Poly-A的LncRNA富集出来参与建库的，没有Poly-A结构的LncRNA是无法富集出来并建库测序，因此只能取得一部分LncRNA结果。